Вот и я не пойму. У работника трудовые отношения с предприятием (и его руководителем), а не с бухгалтером. Почему бухгалтер решает эти вопросы (делать или нет запись в тр.книжке). Выяснить позицию руководителя, он может вообще не в курсе. Деньги вернуть предприятию, как излишне выплаченные. Ну и руководитель сам решит, что делать со своими работниками ( в том числе с бухгалтером).
Добавлю.
Если бухгалтер позвонила и попросила это дело (возврат денег) не афишировать, ведь у всех могут быть ошибки, то это одно дело, а если позвонила с наездом (типа, быстро деньги на бочку, а то записи не будет), то решать проблему с руководством, а не с шантажисткой

Это в случае, если у Вас не возникает вопроса: вернуть деньги или нет, и Вы просто возмущены поведением бухгалтера. А если думаете, вернуть или нет, то не знаю.